SIG名
ハイコンテントスクリーニングと画像解析
開催日時
2019年11月21日(木)13:30~17:30
開催場所
タワーホール船堀 3階または4階会議室
世話人
大野 研 :田辺三菱製薬 (株)
田邊 賢司:東京女子医科大学
山津 維子:塩野義製薬 (株)
開催目的と内容
細胞や個体の表現型を画像解析で評価する“ハイコンテントスクリーニング(HCS)”は、薬効評価や安全性評価などの創薬研究分野で広く利用されており、今後も三次元細胞培養やディープラーニングの活用など大きな可能性を持つ分野です。欧米ではHCS向けのオープンソースの画像解析ソフト「CellProfiler」が多くの製薬企業/大学/研究機関で利用され、多様な解析方法の構築や研究者間での情報共有に役立てられています。本SIGでは、「CellProfiler」の特徴や使い方を紹介することでHCS解析の選択肢を広げ、国内HCSユーザーの交流促進を目指します。
本SIGは二部構成で進行します。前半のチュートリアルではCellProfilerを使った解析方法をレベル別に解説・実演します。後半のグループディスカッションでは、HCSや画像解析における悩みや解決方法に関する事前アンケートを元に、研究者間で議論を深める場を設けます。
プログラム予定
第一部:Cell Profilerチュートリアル
-
HCSにおける画像解析
HCSにおける画像解析の特徴 -
CellProfilerの紹介
CellProfilerの特徴とウェブサイトの紹介 -
解析例_基本編
基本的な解析方法(細胞のカウントや蛍光強度の定量化など)の解説 -
解析例_応用編
画像の光量補正、共局在解析など -
機械学習を用いたクオリティーチェック
CellProfiler Analystを用いた画像のクォリティーチェック
第二部:グループディスカッション
アンケート結果紹介
3つ前後のグループに分けて興味ある分野毎に議論
定員
30名
参加要件
一般公募(オープン)
―HCSを始めたばかりの初級者や現在の画像解析ソフトに不満を感じている中級者を想定しています
―ベンダーの方も参加可能です
―アンケートの事前回答にご協力いただける方に限ります
申込人数超過の場合の調整方針
先着順
本SIG用事前アンケートファイルダウンロード
SIG3_HCS_Analysis_questionnaire.xlsx
(ダウンロードできない場合は、右クリックからダウンロードしてください)
事前アンケートの回答がSIG参加の必須要件です。
事前アンケートは各SIG紹介ページからダウンロード可能です。ダウンロード後、記入して参加登録時に登録フォームより添付してお送りください。なお事前アンケートは世話人にそのまま転送されます。